由火山噴發的熔岩所形成的地形稱為火山地形。澎湖群島大都是由地底深處的玄武岩岩漿組成，經由淺海或陸上的地下裂隙流出地面，經數次間歇性的噴發後，冷卻形成火山熔岩層。

這種火山作用造成的地形大致有下列兩種：

方山地形與熔岩臺地

起初，熔岩向四周泛流形成熔岩臺地，其後因岩層斷裂與升降，並順沿柱狀節理風化和侵蝕之結果，造成頂面平坦而四周海崖圍繞的島嶼，這就是方山地形的由來。例如小雞善嶼為隆起的海蝕平臺、馬公港外的四角嶼和雞籠嶼也都是方山地形的代表。

澎湖各島嶼原本都是玄武岩熔岩流冷卻後形成的熔岩臺地，臺地周圍的玄武岩，受潮汐與海浪或風蝕等作用影響，逐漸形成陡峭的海崖，這便是澎湖方山地形的成因。

岩脈或侵入岩體

當岩漿侵入周圍岩石的裂隙中，凝固成相近於板狀直立的岩體稱為岩脈，岩脈經過不同的侵蝕後，部分形成一列突出地面的岩脊。澎湖地區露出地表的岩脈，寬度大都在50公分左右，長度則大小不等。

此外，澎湖地區還有一些特殊的火山地形，如舌狀或繩狀熔岩流、「火口」或「火口穹狀地」以及岩床。