一般玄武岩的主要礦物為輝石、斜長石及少量的橄欖石。澎湖的玄武岩所含的礦物也大致相同，但澎湖玄武岩流經多次不同時期的熔岩噴發後形成，其礦物在比例或成份上的不同，讓玄武岩的顏色較富變化。

顏色

澎湖玄武岩呈現在地表之顏色自濃黑至灰黑，以至微褐灰色均有。濃黑者以鹼性玄武岩較多，其石基中含有較多量塵埃狀磁鐵礦；結晶較粗的玄武岩風化後，易呈微褐灰色；另多孔狀玄武岩風化後，較易生成灰紅色或淡紫色。顏色變化與岩石成分有直接的關係。